Le président de Cités Unies France est François Rebsamen, Maire de Dijon, Président de Dijon Métropole.
L’association est composée de collectivités territoriales françaises et de leurs groupements, adhérents.
L’association comporte les organes politiques suivants :
- L’assemblée générale qui se réunit au moins une fois tous les ans ;
- Le conseil d’administration, composé au maximum de 42 membres ;
- Le bureau exécutif, composé de 9 membres.
Les nouveaux statuts ont été adoptés par l’Assemblée générale extraordinaire du 28 mai 2019, et modifiés le 4 septembre 2019.